مع اقتراب تولي الرئيس الراحل محمد مرسي السلطة، يونيو/حزيران 2012، وتعهده بإلغاء حالة الطوارئ بعد 30 عاما من العمل بها، أعلن المجلس العسكري إيقاف العمل بها نهائياً يوم 31 مايو/أيار 2012.